La Polizia di Boston ha identificato quella che sembra una fossa comune. Dopo alcune analisi, Jordan e la sua squadra identificano i resti: appartengono ad un gruppo di delinquenti scomparsi nel corso degli ultimi anni. Mentre sta tornando in obitorio con una serie di campioni, Bug viene aggredito ed ora versa in pessime condizioni in ospedale. Woody nutre alcuni sospetti in merito all'improvvisa visita del fratello Calvin, il quale gli aveva telefonato poco tempo prima per chiedergli dei soldi in prestito. Il detective scopre che questi è stato contattato dagli stessi criminali responsabili dell'aggressione a Bug.