Il fallimento di una missione in Pakistan induce gli uomini del Pentagono a ritenere che all'interno della struttura governativa agisca una talpa. Insieme ad un agente dell'FBI, e in gran segreto, Tisnewski indaga per scoprire il responsabile della fuga di informazioni. I sospetti si concentrano su di un ufficiale musulmano che nelle ultime tre settimane ha intrecciato una relazione con il Sergente Pierce. Nel frattempo, Wilkerson affronta la possibile fine del suo matrimonio quando scopre che sua moglie si vede con il marito di una riservista in Iraq. JT consiglia al suo uomo di affrontare il problema. Dopo essere stato tagliato fuori dalle indagini sulla talpa, il Colonnello McNulty ha un malore.