Un operativo della Sezione impazzisce e spara ad Operations durante un briefing. Mentre Operations lotta con la morte, Egran Petrosian, l'agente in copertura visto nella scorsa stagione, prende il controllo della Sezione e promuove Nikita come suo secondo. Nonostante gli avvertimenti di Madeleine, Nikita crede che Petrosian sia meglio di Operations nella guida della Sezione. Ma quando Petrosian chiede a Nikita di uccidere Operations, il futuro della Sezione è nelle sue mani.