A causa di un calo di operativi Nikita viene promossa Capo squadra tre anni prima del previsto. Lei ora è responsabile di ogni aspetto di una missione, selezione del personale, piano e successiva esecuzione. La sua missione è catturare un acquirente di energia nucleare, ma essendo le notizie scarse la missione si rivela più rischiosa del previsto. Come se non bastasse un membro del suo team Vizcano, innamorata di Michael dimostra di non temere la posizione di Nikita e si rivela disobbediente. Nikita deve trovare il modo di controllarla altrimenti rischia di far fallire la missione.