Due paramedici della marina ricevono una chiamata da un'abitazione residenziale, arrivati sul posto vengono però uccisi. La madre di Meredith, Olivia, che lavora al DARPA, viene a trovarla, e le chiede se sa qualcosa sulle misteriose foto contraffatte che le stanno arrivendo dove lei viene immortalata al posto della sorella, che è morta in un incidente, comunque Olivia afferma di non saperne nulla. Pride e la sua squadra indagano sulla morte dei paramedici, e scoprono che a uno di loro manca il tesserino, comprendendo dunque che l'assassino lo ha ucciso propio per avere quel tesserino e entrare indisturbato nell'ospedale militare, infatti il killer uccide i paramedici che stavano trasportando un cuore da trapianto, e spara anche al cuore rendendolo inutilizzabile. Pride e l'NCIS apprendono che il cuore doveva essere donato a un consulente civile dell'esercito, un giovane ragazzo di nome Max Pinzon, un genio dell'informatica a cui Olivia fa da referente, il ragazzo è in pessime condizioni di salute e aveva bisogno di quel cuore per sopravvivere dato che era l'unico compatibile con il suo raro gruppo sanguineo. Pinzon è una risorsa indispensabile per l'esercito dato che sta lavorando a un algoritmo che dovrebbe decriptare le compravendite on-line di armi. Loretta scopre che il cuore a cui hanno sparato non era quello destinato al trapianto, quindi Pride capisce che volevano solo far credere che il cuore destinato a Pinzon fosse inutilizzabile, infine scoprono che il killer lavora al soldo di un signore del crimine che ha bisogno di un trapianto di cuore e che ha lo stesso gruppo sanguineo di Pinzon. Patton, nonostante le iniziali diatribe, si lega molto a Pinzon, poi i due riflettono sul fatto che l'apparecchiatura elettronica di cui si sta servendo il criminale per i suoi problemi cardiaci richiede un costante uso di energia elettrica, quindi la squadra indagando scopre che c'è un ospedale abbandonato che sta consumando molta energia elettrica e capiscono dunque