Tre ufficiali dell’aeronautica prendono il controllo del centro missilistico con l’intenzione di lanciare missili nucleari sulle nazioni islamiche per debellare il terrorismo. Uno di questi è il tenete Miller che aveva avuto una relazione sentimentale con Kensi. Quest’ultima viene inviata alla base per tentare di convincere il capitano a desistere. Nel frattempo la squadra di Callen indaga sulle vite dei 3 ufficiali.