Mick chiede a Lilith di aiutarlo a trovare la prova che lo scienziato che ha proceduto alla clonazione è suo padre. David parla con Shelby Sloane, il quale confessa di aver manipolato il DNA di Mick allo scopo di creare un gemello dell'altro figlio malato. Caroline sospetta che Hira sia in contatto con il fratello, appartenente ad un gruppo terroristico, e provvede a farla allontanare dall'Agenzia. David parla con Hira per cercare di risolvere la situazione. Sandström deve inoltre affrontare un prete fanatico che è convinto che si possa riportare in vita Gesù Cristo mediante il sangue (e quindi il DNA) ancora presente su uno dei chiodi della croce. Il prete è deciso a fare in modo che l'esperimento abbia luogo, ma David cerca di porre un freno al dilagante fanatismo. Nel bel mezzo di una manifestazione pubblica si odono degli spari: David e Hira cadono a terra.