Archer è riuscito a convincere buona parte del Consiglio Xindi, ma non le fazioni insettoidi e rettiloidi, che scagliano comunque la super-arma contro la Terra. Il capitano ed i suoi nuovi alleati dovranno quindi tentare un disperato attacco su vasta scala per distruggerla, prima che Hoshi, rapita dalle fazioni Xindi ribelli e sottoposta a lavaggio del cervello, riesca a decriptare la sequenza di innesco dell'arma, scatenando tutto il suo devastante potere distruttivo. Intanto T'Pol e Trip lavorano su un piano per distruggere una delle sfere metalliche, sperando che questo possa indurre una reazione a catena che metta fuori uso anche tutte le altre e ponga fine alla anomalie spaziali che esse creano all'interno della Distesa Delfica, portando finalmente allo scoperto i loro creatori.