Outbreak (a.k.a. Escalation)

Caffrey cerca un modo per impedire che centinaia di altre persone si infettino mediante la contaminazione del cibo. Chiede perciò aiuto alla dottoressa Daphne Larson, un esperta di botanica, la quale viene messa al corrente del progetto Threshold ed inserita nella squadra. Le condizioni di salute di Lucas peggiorano di ora in ora. Fenway pensa ad una possibile cura sottoponendo il paziente al segnale alieno. Manning si mette in contatto con Caffrey e le fa un'interessante rivelazione: gli alieni stanno cercando di mutare il genere umano per preservare la specie in vista di una catastrofe. Baylock scopre che la recente contaminazione del cibo è il risultato del trasferimento ad altra missione di un gruppo di agenti, voluto dal Consigliere per la Sicurezza Nazionale. Mentre il segnale alieno lo sta ripetutamente colpendo, Lucas fa un sogno nel quale vede un uomo di un'altra epoca che afferma di avere battuto quelli che hanno tentato di cambiare la sua gente. Caffrey riceve un rapporto proveniente dalla Nasa.

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S01E12 - Vigilante