Seizoen 5 begint bij de spreekwoordelijke morning after, als Castle en Beckett geconfronteerd worden met nieuwe vragen - was dit een eenmalige flirt, of zijn ze nu een paar? Maar voordat ze de antwoorden vinden, moeten zij het opnemen tegen degenen die verantwoordelijk zijn voor de moord op Beckett's moeder, die nu Kate Beckett's leven bedreigen. Jack Coleman ("Heroes") speelt een geliefde Amerikaanse senator die in conflict komt met Beckett.