Nezumi-Koozoo IV propose à Goemon Ishikawa XIII de se venger d'une défaite ancestrale subie par leurs prédécesseurs face à Arsène Lupin. Ensemble, ils prévoient de voler des données top secrètes détenues par la police de Sakurada. Pendant ce temps, Lupin et Jigen sont confrontés à Zenigata, qui renforce la sécurité.