Depuis leur rencontre aux toilettes, Hanako-kun et son assistante humaine, Nene Yashiro, font tout ce qui est en leur pouvoir pour maintenir le fragile équilibre entre le monde des humains et celui des esprits. Avec les multiples incidents surnaturels qui ont lieu au sein de l’Académie Kamome, le duo a généralement fort à faire au quotidien !
Mais que font-ils lorsqu’ils ont un petit moment de répit ? Participer à des jeux, changer de sexe, tomber malades, ou encore découvrir les nombreux secrets qui bouleversent le monde : les activités ne manquent pas lorsqu’il s’agit de passer un peu de bon temps après les cours…