Rodney, Teyla, Ronon y Sheppard se encuentran en una misión cuando son atacados. Tratan de huir por el Stargate pero Sheppard es capturado por Acastus Kolya y sus hombres. Desde Atlantis tratan de averiguar si han sido los Genii son los culpables pero el antiguo jefe científico Ladon Radim llega a Atlantis y afirma que él no es responsable de la captura de Sheppard.
Sheppard es encerrado en una celda y pronto conoce a su nuevo compañero de prisión, alguien en otra celda que dice llevar muchos años allí encerrado y que no hay forma de escapar. Pronto es utilizado por Kolya para chantajear a Weir, quiere a Ladon a cambio de Sheppard. Tienen un plazo corto para hacerlo, tres horas, y para hacerlo más creíble utiliza al compañero de celda de Sheppard, un Wraith, para sacarle la vida poco a poco. En caso de no hacer lo que pide dejará que el Wraith acabe con su vida.
La razón de que Kolya quiera a Ladon es su rivalidad, ya que Kolya quiere el poder el cual cree que le pertenece legítimamente y al ser arruinados sus planes por Ladon, quien informó al gobierno de proyectos de su rival. Ladon acuerda a ayudar al equipo a buscar a Sheppard. Con la información que él proporciona, el equipo encuentra un puesto avanzado Genii, pero rápidamente descubren que es un callejón sin salida.