Rin y su hermano gemelo Yukio han crecido bajo la tutela de un renombrado sacerdote exorcista, el padre Shirô Fujimoto. Un día, sin embargo, Rin se entera de que su padre biológico no es otro que el mismísimo Satanás. Ante la invasión de entidades malignas que cruzan la frontera entre "Assiah", el reino de los humanos, y "Gehenna", el dominio de los demonios, Rin jura convertirse en el exorcista más consumado para derrotar a su padre, Satanás. Para realizar esta ambición, se matricula en la Academia de La Croix-Vraie para aprender las artes del exorcismo...