Het team van Kusanagi gaat onder leiding van Aramaki als de Shell-eenheid aan de slag. Dan raakt het cyberbrein van de tolk van de minister van Buitenlandse Zaken besmet met een virus. Aramaki vermoedt dat kolonel Malles, die in ballingschap buiten de stad verblijft, een geheime bijeenkomst probeert te verstoren. Hij geeft Kusanagi de opdracht de hack te onderzoeken en de dader op te sporen.