Après avoir affronté les troupes secrètes du WARP (les services secrets de la Fédération Mondiale) qui voulaient libérer Chichen-Itza les premiers et peut-être faire un putsch avec à sa tête Herb Forsythe III, Chris Colorado, Jack Mitchell et Chippowok s’introduisent par une rivière souterraine dans la Ville Protégée. Après avoir créé des diversions, Colorado lance le signal: les Héli-Troopers attaquent les Thanors qui tiennent encore la ville... La grande bataille pour la Liberté vient de commencer.