Alice volta para casa e seu pai lhe conta que todos achavam que ela tinha morrido. Suas histórias mirabolantes sobre um coelho branco falante e um lugar místico chamado País das Maravilhas terminam fazendo com que ela seja internada. No manicômio, o Dr. Lydgate a convence a fazer uma operação que vai permitir que ela esqueça tudo isso. Logo antes do procedimento começar, ela é resgatada pelo Cavaleiro de Copas que a leva até o Coelho, que a informa de que seu verdadeiro amor, Cyrus, ainda está vivo. Quando o trio atravessa o portal para retornar ao País das Maravilhas, Alice começa uma jornada para encontrar Cyrus, mas os terríveis Jafar e a Rainha Vermelha têm outros planos para ela.